Le centre de compétence Maladies auto-immunes systémiques rares est intégré à l’Institut de médecine interne de l’Est Parisien (IMIEP), composé du service de médecine hospitalière de l'Hôpital Fondation Rothschild et du pôle de médecine interne du Groupe Hospitalier Diaconesses-Croix Saint Simon.
Les équipes de l’Hôpital Fondation Rothschild du centre de compétence Maladies auto-immunes systémiques rares prennent en charge des patients atteints de pathologies de l’œil et de l’orbite :
Le centre de compétences s’intègre à la filière de santé des maladies auto-immunes et auto-inflammatoires rares FAI²R.
Le centre de compétence Maladies auto-immunes systémiques rares fait partie de la plateforme d'expertise maladies rares de l'Hôpital Fondation Adolphe de Rothschild.